Ол он тоғыз адамның өмірін қиған 2000-шы жылы болған терактіні ұйымдастырған деп айыпталуда.
Сот барысында куәгерлердің бірі , “Абу Бакар Башир өткен жылы қазан айында Бали аралында болған жарылысқа қатысы бар деген эктремистік топты басқарады”- деп хабарлады.
Сондай-ақ, Сингапурден бейне телефон арқылы хабарласқан куәгерлерлер Баширді Индонезия премьер-министрі Мегавати Сукарнопутриге қастандық жасауға дайындалғандар ішінде бар деп айыптады.